成神阳太（花江夏树 配音）是一位非常平凡的男子高中生，正在享受他高中生涯里的最后一个暑假。一天，正在篮球场打球的阳太邂逅了一位名叫佐藤雏（佐仓绫音 配音）神秘少女，少女告诉了阳太一个惊人的消息——“30天后，世界就会毁灭”。阳太收留了无家可归的雏，虽然对她的暴言半信半疑，但雏所展现出的准确的预知能力让阳太渐渐开始相信她所言非虚。个性沉稳成绩优异的伊座并杏子（石川由依 配音）、外表看似冷淡但实际上有着一副热心肠的国宝阿修罗（木村良平 配音）、总是懒懒散散大大咧咧的成神空（桑原由气 配音），雏很快就交到了一群好朋友。

在未来世纪（Future Century，F.C.）由于地球严重被污染，人类移往宇宙殖民星，建立了新中国、新日本、新美国等殖民星国。各国在地球虽然还存有领土，但已受到严重的忽视。　　为了避免战争，各国决定以一场高达擂台赛(Gundam Fight，高达武斗)来决定各殖民星国对地球的统治权。比赛每四年一度，以地球为擂台，每个国家（殖民星）派出一位代表参赛，一对一以高达对战，直至只有一名胜利者。胜利者所属国家可擭得各殖民星国及地球管理权四年，直至另一个国家在下一次高达对决获胜。　　而活在地球上的居民，便要忍受在各国代表在对战时所造成的破坏。　　故事发生在未来世纪六十年开始，当时正开始第十三届高达擂台赛。故事的主角，来自新日本的code error!，为了追寻盗去以DG细胞三大理论，自我增殖、自我再生、自我进化设计出来的code error!(Devil Gundam)的兄长，决定参加这一次的高达对决，故事就此展开。

主角罗那（兰拿）是一个平凡的月之子（月之居民）。为贯彻月之女王迪安娜的回归地球行动而与另外两个同伴一同被送到地球。因不适应新环境而几乎遇险，被姬艾尔苏菲亚姐妹所救而为她们家打工。在一次偶然的机会下发现了埋在矿山中的Turn A Gundam并凭借月之子的经验判断力而驾驶其对抗入侵的月之回归军。动画并没有特意便标榜罗那为New Type。剧中一些细节，例如罗那变装美女“罗伦”，用高达运牛，洗衣服等等都为这部高达增添了一份前所未有的轻松感．　　罗兰肩负月之住民的期望，他是为了用自己的肉体证明月之住民适合地球的环境而被送来的少年中的一人。这是月之住民为回到地球而进行的战斗的第一步，可说是一种献身的行为，罗兰顺利地完成了任务，少年们自从落到地球后，适应了地球的环境并溶入了这里的社会……他们相信，当月球的同伙们访问地球的时候，无论是月之住民还是地球人都可以拉起手来成为朋友。　　但是现实无情地打碎了少年们的理想。地球人与月之住民各自的道路是不同的，要让两支小流合成一条大河，也许冲突将不可避免。乘上MS的罗兰，虽是月球人，但却成为地球上最强的战斗力。面对最崇拜的月之女王还有在他身上寄予厚望的一帮地球朋友他将怎么样选择自己的命运？？面对苏菲雅和迪亚娜女王（甚至是高安少爷）的爱他又该何去何从？？面对最终劲敌金卡拉姆的Turn X他又将如何应付？？

这是，人类与超越人智的存在之间的诀别与共存的故事。社会上的大部分都交由名为hIE的人型机器人管理的世界。17岁的少年·远藤新人，某天与一台人型机器人·蕾西亚相遇，并与之缔结了主从契约。外表与人类一模一样的“那个物体”，是具备震惊世界性能的超高性能AI所诞生出来的，超越人智的五台人型机器人“人类未到产物”之一——。五台机体各自拥有自身的意义，为了得到对方的性能而开战。仅仅只能旁观这场战斗的大人们，与接近这一存在、试图建立新的关系的少年们。他们寻求着通向未来的选择，以及人类与物体之间关系的答案——。过度进化的机械，与人类世界的联系是什么？在过于便利的这个时代，什么是重要的，什么是必要的，新人通过与远优于人类的人型机器人·蕾西亚的相遇，寻求着通向未来的选择，以及人类与物体之间关系的答案——。

这是一个黑白颠倒欲望横行的罪恶时代，贫富差距的急剧增大直接导致了罪恶和仇恨的火种开始暗自燃烧。在六木本俱乐部中有着一个关于“女神”的传说，传说中，只要得到了女神的祝福，便能够实现所想的愿望。前战地摄影师雑贺辰己（高田裕司 配音）正在调查一宗议员谋杀案，误打误撞之中，他得到了女神——少女天王洲神乐（斉藤圭 配音）的吻，当他因拍下了女神容貌而被追杀的时候，辰己发现自己奇迹般的拥有了不死之身，而手中的相机，似乎也有了如同武器一般的强大威力。长久以来，神乐都遭受着母亲天王洲神泉（高岛雅罗 配音）的虐待，成为女神，更是由于被催眠之故。于是，辰己带着神乐，利用自己“写杀”的异能力，开始了一段惊险而又刺激的逃亡之旅。

“权力就是一切。”风间仁自小学习妈妈的家族自卫术“风间流古武术”，但强大如他，也有软弱无力的时候。一个阴险狡猾的恶魔突然出现，摧毁风间仁挚爱的一切，他的人生就此改写。风间仁眼睁睁地看著一切发生，却无能为力。气愤难平的他，矢言寻求最强大的力量，藉此报仇雪恨。他竭力奋斗，最终踏上铁拳王锦标赛的国际舞台。

楠木赖子（高桥美佳子配音）是个14岁的初中生，在班上没什么朋友，但偶然得到班上极为耀目的美少女柚木加菜子（戸松遥配音）的青睐，两人成为朋友，不料相约乘电车去看湖时飞来横祸，加莱子落下站台被列车轧成重伤。刑警木场修太郎（关贵昭配音）调查此案，发现加莱子似乎有着神秘的重要身份，同时以多摩为中心，整片地区陆续发现许多被分尸的尸体残块，关注整个事件的中禅寺敦子（桑岛法子配音）、关口巽（木内秀信配音）、鸟口守彦（浪川大辅配音）为了写出内幕报道，调查中在森林中发现古怪建筑物，如巨大的匣子，一切谜底的最终还要靠京极堂（平田広明配音）揭开……

漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，...

柯南、灰原及少年侦探队成员步美、光彦、元太随博士这日露营完毕，绕道参观西多摩市新建于富士山前的日本第一双塔摩天大楼，毛利小五郎恰也应双塔所有者、他的学妹常盘美绪之邀，携小兰、园子参加开幕典礼。美绪介绍...

在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美配音）和葛城美里（三石琴乃配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机，抵抗了第八使徒猛烈的攻击，在这一过程中，淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生。不久后，第九、十使徒相继降临，真嗣他们面临着生与死的残酷考验……本片为福音战士新剧场版四部曲第二部。